Cơ quan tham mưu, giúp việc

• Vụ Cơ khí, Luyện kim và Hóa chất
• Vụ Năng lượng và Dầu khí
• Vụ Công nghiệp tiêu dùng và thực phẩm
• Vụ Kế hoạch và Đầu tư
• Vụ Tài chính kế toán
• Vụ Khoa học - Công nghệ
• Vụ Quan hệ quốc tế
• Vụ Pháp chế
• Vụ Tổ chức, cán bộ
• Cục Công nghiệp địa phương
• Cục Kỹ thuật an toàn công nghiệp
• Cục Điều tiết điện lực
• Thanh tra
• Văn phòng Bộ

Cơ quan sự nghiệp

• Viện Nghiên cứu chiến lược và chính sách công nghiệp
• Viện Nghiên cứu cơ khí
• Viện Khoa học công nghệ Mỏ và Luyện kim
• Viện Nghiên cứu Điện tử - Tin học - Tự động hoá
• Viện Công nghệ thực phẩm
• Viện Nghiên cứu Dầu thực vật - Tinh dầu - Mỹ phẩm
• Viện Nghiên cứu Da giày
• Viện Nghiên cứu sành sứ thủy tinh
• Trung tâm Tin học
• Trung tâm y tế - Lao động và Môi trường trong công nghiệp
• Báo Công nghiệp
• Tạp chí Công nghiệp

Các cơ sở đào tạo trực thuộc Bộ

• Trường Đại học Công nghiệp Hà Nội
• Trường Đại học Công nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh
• Trường Đại học Công nghiệp Việt Trì
• Trường Cao đẳng Công thương
• Trường Cao đẳng Công nghiệp thực phẩm TP Hồ Chí Minh
• Trường Đại học Kinh tế - Kỹ thuật Công nghiệp
• Trường Cao đẳng Kỹ thuật Mỏ
• Trường Cao đẳng Công nghệ thực phẩm
• Trường Cao đẳng Cơ khí luyện kim
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Nam Định
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Phúc Yên
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Thái Nguyên
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Việt - Đức
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Huế
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Tuy Hoà
• Trường Cao đẳng Kỹ thuật Cao Thắng
• Trường Cao đẳng Kinh tế công nghiệp Hà Nội
• Trường Đại học Sao Đỏ
• Trường Cao đẳng Công nghiệp và Xây dựng
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Xây lắp điện
• Trường Quản lý Kinh tế công nghiệp
• Trường Cao đẳng Công nghiệp Cẩm Phả
• Trường Trung học Kỹ thuật công nghiệp